Włodzimierz Niderhaus był związany z Wytwórnią Filmów Dokumentalnych i Fabularnych w Warszawie związany od 1970 roku, a od 21 czerwca 1990 roku był dyrektorem instytucji. Od 2019 roku kierował pracami nowej państwowej instytucji kultury utworzonej pod taką samą nazwą, skupiającą wszystkie studia filmowe. W latach 2005-2008 i 2014-2017 zasiadał w Radzie Polskiego Instytutu Sztuki Filmowej.
Był członkiem Polskiej Akademii Filmowej i Europejskiej Akademii Filmowej. W latach 2000-2019 pełnił funkcję wiceprezesa Krajowej Izby Producentów Audiowizualnych (KIPA). Był producentem lub koproducentem ponad 200 filmów dokumentalnych i fabularnych, także tych nagradzanych jak "Róża" Wojciecha Smarzowskiego, "Różyczka" Jana Kidawy-Błońskiego czy "Rewers" Borysa Lankosza. W jego filmografii są też takie tytuły jak "Komornik", "Mała matura 1947", "Ostatnia misja", "Poranek kojota", "Ile waży koń trojański?", "U Pana Boga w ogródku", "Galerianki", "Poniedziałek", "Jasminum", "Vinci", "Moje córki krowy", "E=mc2", "Boisko bezdomnych" czy "Generał Nil".
Włodzimierz Nideraus otrzymał Krzyż Oficerski Orderu Odrodzenia Polski za wybitne zasługi dla kultury narodowej, Złoty Medal "Zasłużony Kulturze - Gloria Artis" oraz Złote Lwy dla producenta najlepszego filmu 35. FPFF w Gdyni - za "Różyczkę". Otrzymał także Srebrne Lwy 40. Festiwalu Filmowego w Gdyni jako producent filmu "Excentrycy, czyli po słonecznej stronie ulicy" w reżyserii Janusza Majewskiego.